<p>W siódmym odcinku Franek i Jakub rozmawiają o kodzie genetycznym, genomie wirusa pszczoły DWV oraz genomie mitochondrium pszczoły AMM. Do zabawy w rozkodowanie genomu wirusa pszczoły i mitochondrium pszczoły - zainspirowali się po obejrzeniu serii dr Łukasza Lamży <a href="https://www.youtube.com/watch?v=mBvD0qrQtU4&list=PLuqpwpkBmbAliSTk1KaoZP_-V-5IYOGa2&index=3">“Koronawirus pod lupą”</a>. Wirus DWV to jeden z najbardziej znanych wirusów pszczoły miodnej i nie tylko miodnej. Kiedy namnoży się w ciele pszczoły w odpowiedniej ilości powoduje deformację skrzydeł uniemożliwiającą pszczole latanie, stąd jego nazwa: wirus zdeformowanych skrzydeł (po angielsku: deformed wing virus). W swojej zjadliwej formie choroby potrafi doprowadzić rodzinę pszczelą do zgonu. Zgodnie z sugestiami dr Łukasza Lamży najpierw pobraliśmy pełny zapis nukleotydów wirusa DWV typu A i mitochondrium pszczoły miodnej ciemnego podgatunku z <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore">tej strony</a>. Później w programie Libre Office zamieniliśmy wersję zapisu informacji genetycznej z DNA na RNA oraz oczyściliśmy zapis z niepotrzebnych znaków. Następnie przepuściliśmy tak uzyskany czysty zapis nukleotydów przez <a href="https://web.expasy.org/translate">aplikację</a> do odczytania tzw. otwartych ramek odczytu (czyli już genów, które kodują określone białka). Wzięliśmy jedno z białek wirusa pszczoły i za pomocą <a href="https://swissmodel.expasy.org/interactive">aplikacji</a> uzyskaliśmy model jego pięknej struktury przestrzennej. Wisienką na torcie, zresztą również zaproponowaną przez dr Łukasza Lamżę, było zainstalowanie na naszych komputerach gry Foldit. Czyli pożyteczną grę komputerową, w której - po wstępnym przyuczeniu - można układać przestrzennie struktury białek, pomagając przy okazji nauce. Jak okazuje się nie gorzej niż algorytmy sztucznej inteligencji. Bardzo ciekawe. Zdradzimy, że Franek tak się wkręcił, że gra prawie codziennie i może niebawem przejdzie wszystkie etapy szkoleniowe.</p>
<footer><ul>
<li>wydawca: <a href="https://warroza.pl">warroza.pl</a>
</li>
<li>muzyka do Intro: Jonas - Andreas + DSP: CC BY-NC-SA</li>
</ul>
</footer>
